JGG >>2003 >>30 >>(12)
JGG 2003, 30(12) 1101-1106 DOI:      ISSN: 1673-8527 CN: 11-5450/R           
  

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微卫星标记
基因组扫描
多重PCR
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对中国农业大学鸡资源群进行基因组扫描的初步分析
胡晓湘1;4;黄银花1;高宇1;杜志强2;冯继东1;徐慰倬1;邓学梅2;张莹1;樊宝良3;赵志辉1;刘兆良1;杨宁2;金宁一4;吴常信2;李宁1
1.中国农业大学农业生物技术国家重点实验室;北京 100094; 2.中国农业大学动物科技学院;北京 100094; 3.河北邯郸农业高等专科学校;邯郸 057150; 4.解放军军需大学军事兽医研究所;长春 130062
摘要: 利用PCR结合荧光半自动检测技术对中国农业大学鸡资源家系的1个包括440个个体的3代群体进行了大规模基因组扫描,分析了55个微卫星标记位点。经家系分析表明,这些位点都符合孟德尔共显性遗传规律,其杂合度在0~0.86之间,其中72%的位点的杂合度>0.60;多态信息含量在0~0.88之间,73%的位点的PIC>0.50。A系和C系群体在55个位点中的绝大多数位点上存在非共有等位基因,两个品系在大多数位点的等位基因和等位基因频率差异显著(P<0.05),许多位点差异达到极显著水平(P<0.01);C系显示出更高的群体整齐度。利用55个微卫星位点的等位基因频率,计算出A系和C系的奈氏群体间相似系数I和标准遗传距离D分别为0.1002和0.8928.
关键词微卫星标记      基因组扫描   多重PCR  
Preliminary Analysis on China Agricultural University Chicken Resource Population Based on Genomic Scanning
HU Xiao-Xiang1,4; HUANG Yin-Hua1; GAO Yu1; DU Zhi-Qiang2; FENG Ji-Dong1; XU Wei-Zhuo1;DENG Xue-Mei2; ZHANG Ying1; FAN Bao-Liang3; ZHAO Zhi-Hui1; LIU Zhao-Liang1; YANG Ning2; JIN Ning-Yi4; WU Chang-Xin2; LI Ning1
1.The State key Laboratory for Agro-biotechnology, China Agricultural University, Beijing 100094,China 2.College of Animal Science and Technology, China Agricultural University,Beijing 100094,China 3.Handan Agricultural College, Handan 057150, China 4.The Military Veterinary Institute, Quartermaster University of PLA, Changchun 130062,China
Abstract: Combining the technique of multiplex-PCR and the fluorescent semi-automated detection, a large-scale genome scanning was performed for 440 chickens, which was derived from China Agricultural University chicken resource families, within three generations. Fifty-five microsatellite markers were analyzed for this study. Those 55 microsatellite loci accorded with the characters of Mendelian co-inheritance. The heterozygosities ranged from zero to 0.89, with 72% of loci having a heterozygosity of more than 0.60. The polymorphism information content (PIC) ranged from 0 to 0.85, in which 70% of those loci had a PIC of more than 0.50 but their distribution varied in line A and line C. The allele frequency was significantly different between line A and line C at most loci (P<0.01).At the same time, gene accordance inclination was found in line C. The Nei population resemble coefficient and standard genetic distance were 0.1002 and 0.8928.
Keywords: microsatellite marker   chicken   genomic scanning   mutiplex PCR  
收稿日期 1900-01-01 修回日期 1900-01-01 网络版发布日期 2003-12-10 
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